MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880204

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013168	TTAA	2	8	917	924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013168	ATT	2	6	954	959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013168	TTA	2	6	964	969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013168	TAAA	2	8	1015	1022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013168	TAT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013168	CT	4	8	1756	1763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013168	AAC	2	6	1804	1809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013168	ATTA	2	8	1914	1921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013168	TTAGA	2	10	2374	2383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013168	CAG	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013168	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013168	TG	3	6	5392	5397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013168	TAA	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013168	AACA	2	8	5433	5440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013168	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013168	ATT	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013168	TAA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013168	A	7	7	5559	5565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013168	AGA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013168	T	6	6	5675	5680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013168	AGG	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013168	TAA	2	6	5748	5753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013168	A	7	7	5767	5773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013168	GTT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013168	AAG	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013168	ATA	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013168	TA	3	6	6958	6963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013168	AGAA	2	8	7000	7007	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013168	A	7	7	7006	7012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013168	TTTA	2	8	7023	7030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013168	CGG	2	6	7097	7102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013168	CCG	2	6	7106	7111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013168	AGC	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013168	GCT	2	6	7127	7132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013168	AGC	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013168	CTTA	2	8	7182	7189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013168	TTAA	2	8	8662	8669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013168	CT	3	6	8881	8886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013168	TAAA	2	8	8894	8901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013168	TAA	2	6	8902	8907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013168	TC	3	6	8926	8931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013168	AGAC	2	8	8949	8956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013168	CCGT	2	8	8983	8990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013168	TTG	2	6	9002	9007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013168	AG	3	6	9560	9565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013168	T	8	8	9619	9626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013168	G	6	6	9654	9659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013168	TCG	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013168	TAA	2	6	9703	9708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013168	GAAA	2	8	10349	10356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013168	ACTT	2	8	10836	10843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013168	TAA	2	6	10873	10878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013168	TAA	2	6	10898	10903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013168	T	7	7	10906	10912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013168	ATTT	2	8	10957	10964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013168	TTACA	2	10	10981	10990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013168	AGTT	2	8	11013	11020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013168	A	6	6	11026	11031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013168	TAC	2	6	11032	11037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013168	TTATCT	2	12	11042	11053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013168	AAT	2	6	11074	11079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013168	ATA	2	6	11148	11153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013168	TTGCTT	2	12	11174	11185	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.